Въпреки че в този смисъл тя е по-малко опасна от алкохола, кофеинът може също да подобри страничните ефекти на някои лекарства или да промени тяхното функциониране.
Кофеинът противодейства на действието на лекарствата за безсъние, противодейства на седативните ефекти и увеличава трудността да заспи.
При лица, лекувани с бронходилататори теофилин, аминофилин или други свързани ксантини, кофеинът може да предизвика възбудимост, тахикардия, тремор и нервност.
Кофеинът също така увеличава риска от странични ефекти на някои лекарства, използвани в психиатрията, като антипсихотичния клозапин; той също така намалява плазмените нива на лития.
Хинолоновите антибиотици като еноксацин, ципрофлоксаксцин, грепафлоксацин, левофлоксацин и норфлоксацин причиняват натрупване на кофеин (високи дози кофеин в организма могат да причинят проблеми с гадене, повръщане, нервност, тревожност, тахикардия и конвулсии).
Кофеинът взаимодейства с инхибиторите на МАО, увеличавайки ефекта на стимула върху симпатиковата. Следователно, епизоди на сърдечна аритмия или тежка хипертония могат да възникнат от свързването на МАО-инхибитори и кофеин.
При пациенти, лекувани с антикоагуланти (кумадин - варфарин), анти-агрегиращият ефект на кофеина увеличава риска от кървене.
Кофеинът намалява ефективността на лекарствата, използвани за борба с уринарната инконтиненция.
В случай на асоцииране с НСПВС, кофеинът може да усили ефекта на гастролизата на последния.
Нивата на серумния кофеин могат да бъдат повишени чрез едновременния прием на перорални контрацептиви.
В заключение, нека помним, че кофеинът се съдържа не само в кафето, но и в много храни, като кока-кола, енергийни напитки и чай, и в някои хранителни добавки (например тези, съдържащи кола, мате или гуарана).
