Вирусът Марбург носи името си от едноименния немски град, където за първи път се появява през 1967 г., когато е причината за три едновременни епидемични огнища в Германия (град Марбург и Франкфурт) и в бивша Югославия (Белград). И в двете страни вирусът Марбург вероятно беше въведен с вноса на зелени маймуни от Уганда ( Cercopithecus aethiops, известен също като Cercopiteco grigioverde).
Първите случаи са регистрирани сред персонала в лаборатория в близък контакт с тези примати. Вторичните случаи включват болничен персонал в болнични заведения, изложен на заразени биологични материали.
Впоследствие в Южна Африка, Кения, Демократична република Конго и Ангола са регистрирани спорадични епизоди или реални епидемии за общо около 600 случая и 480 смъртни случая.
